安徽农业大学研究生教育始于1978年，当年设立研究生教育科，1997年设立研究生部，1998年成立研究生处，2005年成立研究生学院。在校党委和校行政的领导下，全面负责学校学位与研究生教育管理工作。1981年我国实施学位制度后，我校是首批获得硕士学位授予权的高校，1998年获得博士学位授予单位。
学校根据国家经济建设与社会发展的需要，不断推进学科专业建设，逐步形成以农学为主体，工学、理学、管理学、经济学、法学等多学科交融发展的学科体系。现有11个一级学科博士学位授权点，17个一级学科硕士学位授权点，1个二级学科硕士学位授权点，11个硕士学位授权类别。学校现有16个研究生培养学院，硕士研究生5700余人（含非全日制研究生），博士研究生500余人，近年来，安徽农业大学研究生教育以 “服务需求、提高质量”为主线，加强研究生思想政治工作，强化导师立德树人职责，创新研究生培养模式，聚焦学位点建设，拓展国际合作，构建质量监督保障体制，优化整合资源，不断适应我国研究生教育发展的新形势。
坚持扎根江淮大地办教育，与大院大所联合攻关，与乡村振兴合作企业战略联盟企业、校友企业等合作推进，形成了集“综合试验站+科技小院”、“科技特派员+科技小院”等多种形式为一体的“一线建小院、小院筑大院”的安农科技小院建设模式。现建成“科技小院”36个，分布全省13个地级市、28个县区，涵盖水稻、玉米、大豆、茶叶等主要粮食和经济作物。获批国家级研究生教学成果奖二等奖一项；教育部办公厅 农业农村部办公厅 中国科协办公厅支持建设科技小院16个；中国农村专业技术协会支持建设“科技小院”9个。
